Sprendimas dėl akademinio pripažinimo, priimtas Studijų kokybės vertinimo centro, gali būti skundžiamas švietimo, mokslo ir sporto ministro sudarytai Išsilavinimo ir kvalifikacijų, įgytų pagal užsienio valstybių ir tarptautinių organizacijų švietimo programas, akademinio pripažinimo apeliacinei komisijai teikiant apeliaciją arba Lietuvos Respublikos administracinių bylų teisenos įstatymo nustatyta tvarka kreiptis į Regionų administracinį teismą.

Apeliacija pateikiama per 10 darbo dienų nuo Studijų kokybės vertinimo centro sprendimo gavimo dienos. Apeliacija teikiama Studijų kokybės vertinimo centrui, kuris ją ir su ja susijusius dokumentus persiunčia Komisijai. Apie galimybę apskųsti sprendimą visada nurodoma Studijų kokybės vertinimo centro sprendime.

Apeliaciją Švietimo, mokslo ir sporto ministerijos sudaryta Išsilavinimo ir kvalifikacijų, įgytų pagal užsienio valstybių ir tarptautinių organizacijų švietimo programas, akademinio pripažinimo apeliacinė komisija išnagrinėja per vieną mėnesį nuo jos gavimo dienos; į šį terminą neįskaičiuojami liepos ir rugpjūčio mėnesiai.